要維護大型魚缸生態系統，首要的是明確自己的大型魚缸缺少哪些關鍵元素，安置的元素之間的比例是否適當。缺少的元素越少，各元素的比例越接近自然條件，所需的維護工作也越少；反之，就要花費較多的力氣了。以下舉兩個具體例子進行說明。
方法/步驟
設置只有沉水生化過濾器的單純養魚的“裸缸”
這里，除了缺少上面提到過的浮游生物外，還缺少食腐的底棲動物，以及可以吸收廢物制造氧氣的高等水生植物；另外，這種缸要達到觀賞上較豐滿的感覺，放養魚只的密度常常會到達過濾器所能承受的上限，也就是說細菌和魚類的比例接近失衡。維護這樣的魚缸，我們除每天喂食外，必須定期吸出缸底的殘餌和糞便（代替底棲動物和水草，底棲魚類如琵琶可以部分替代這一工作），較頻繁的換水以稀釋有害廢物（代替水草的功用，彌補細菌的不足，在這種情況下，沒有水草的幫助，生物過濾即使滿負荷運轉也難以清除所有廢物），在水溫較高時還需要用氣泵打氣（代替水草制造氧氣的功能）。當然，放養的魚種也有很大關系，如果300L的缸里養一條龍魚，大可不必如此麻煩，只要每天撈出殘餌和糞便就可以了；但如果是養了一大群七彩，這些操作就成了幾乎每天必修的功課。
設置具有生化過濾器、底砂、大量水草、食藻蝦和少量魚只的“水草大型觀賞魚缸”這樣的缸里，除了浮游生物外，似乎所有主要元素都齊備，那么是否除了喂食就沒有事可做了呢？確實，這種水草生態大型觀賞魚缸的維護工作是較少的，但并不是說它就完備，其實這個系統各元素間的比例是嚴重失衡的--魚只太少，代謝的廢物很少，而水草、細菌則相對過量，于是整個水體呈現“負營養化”，這對抑制藻類、促進魚只健康大有好處，但對水草和細菌而言就不是什么好事了，它們會因營養不良而趨于衰弱，如果不及時干涉，整個系統會由于水草的凋亡而瓦解，辛苦創造的水族美景就不復存在了。于是我們添加各種肥料，添加二氧化碳，添加硝化細菌……另外，由于缺乏食草動物（這是我們避免引入水草大型觀賞魚缸的），水草的生長不受控制，就需要我們定期的修剪，去除枯葉爛葉，截短長得過長的莖干，調整生長密度……
注意事項
前面舉的是常見的兩個極端情況，我也經歷了從一個極端到另一個極端的過程。其實不管哪種情況，只要注意調整魚只的種類和密度，是可以逐漸達到平衡狀態的，但要注意這種平衡是隨時變化的，我們的維護工作也要隨它的變化而調整，換水的周期，肥料的用量等等都應視具體情況而定。這就需要長期細致的觀察與實踐，不是幾句話可以交代清楚的。另外，用盡可能大的生物過濾器對維持水質穩定很有好處，如果是非水草大型觀賞魚缸，那么最好用滴流式過濾器。
